Bioinformatika

Bioinformatika merupakan ilmu terapan yang lahir dari perkembangan teknologi informasi dibidang molekular. Pembahasan dibidang bioinformatik ini tidak terlepas dari perkembangan biologi molekular modern, salah satunya peningkatan pemahaman manusia dalam bidang genomic yang terdapat dalam molekul DNA.

Kemampuan untuk memahami dan memanipulasi kode genetik DNA ini sangat didukung oleh teknologi informasi melalui perkembangan hardware dan soffware. Baik pihak pabrikan sofware dan harware maupun pihak ketiga dalam produksi perangkat lunak. Salah satu contohnya dapat dilihat pada upaya Celera Genomics, perusahaan bioteknologi Amerika Serikat yang melakukan pembacaan sekuen genom manusia yang secara maksimal memanfaatkan teknologi informasi sehingga bisa melakukan pekerjaannya dalam waktu yang singkat (hanya beberapa tahun).

Perkembangan teknologi DNA rekombinan memainkan peranan penting dalam lahirnya bioinformatika. Teknologi DNA rekombinan memunculkan suatu pengetahuan baru dalam rekayasa genetika organisme yang dikenala bioteknologi. Perkembangan bioteknologi dari bioteknologi tradisional ke bioteknologi modren salah satunya ditandainya dengan kemampuan manusia dalam melakukan analisis DNA organisme, sekuensing DNA dan manipulasi DNA.

Sekuensing DNA satu organisme, misalnya suatu virus memiliki kurang lebih 5.000 nukleotida atau molekul DNA atau sekitar 11 gen, yang telah berhasil dibaca secara menyeluruh pada tahun 1977. Kemudia Sekuen seluruh DNA manusia terdiri dari 3 milyar nukleotida yang menyusun 100.000 gen dapat dipetakan dalam waktu 3 tahun, walaupun semua ini belum terlalu lengkap. Saat ini terdapat milyaran data nukleotida yang tersimpan dalam database DNA, GenBank di AS yang didirikan tahun 1982.

Bioinformatika ialah ilmu yang mempelajari penerapan teknik komputasi untuk mengelola dan menganalisis informasi hayati. Bidang ini mencakup penerapan metode-metode matematika, statistika, dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah biologi, terutama yang terkait dengan penggunaan sekuens DNA dan asam amino. Contoh topik utama bidang ini meliputi pangkalan data untuk mengelola informasi hayati, penyejajaran sekuens (sequence alignment), prediksi struktur untuk meramalkan struktur protein atau pun struktur sekunder RNA, analisis filogenetik, dan analisis ekspresi gen.

Bioinformatika pertamakali dikemukakan pada pertengahan 1980an untuk mengacu kepada penerapan ilmu komputer dalam bidang biologi. Meskipun demikian, penerapan bidang-bidang dalam bioinformatika seperti pembuatan pangkalan data dan pengembangan algoritma untuk analisis sekuens biologi telah dilakukan sejak tahun 1960an.

Kemajuan teknik biologi molekuler dalam mengungkap sekuens biologi protein (sejak awal 1950an) dan asam nukleat (sejak 1960an) mengawali perkembangan pangkalan data dan teknik analisis sekuens biologi. Pangkalan data sekuens protein mulai dikembangkan pada tahun 1960an di Amerika Serikat, sementara pangkalan data sekuens DNA dikembangkan pada akhir 1970an di Amerika Serikat dan Jerman pada Laboratorium Biologi Molekuler Eropa (European Molecular Biology Laboratory).

Penemuan teknik sekuensing DNA yang lebih cepat pada pertengahan 1970an menjadi landasan terjadinya ledakan jumlah sekuens DNA yang dapat diungkapkan pada 1980an dan 1990an. Hal ini menjadi salah satu pembuka jalan bagi proyek-proyek pengungkapan genom, yang meningkatkan kebutuhan akan pengelolaan dan analisis sekuens, dan pada akhirnya menyebabkan lahirnya bioinformatika.

Perkembangan jaringan internet juga mendukung berkembangnya bioinformatika. Pangkalan data bioinformatika yang terhubungkan melalui internet memudahkan ilmuwan dalam mengumpulkan hasil sekuensing ke dalam pangkalan data tersebut serta memperoleh sekuens biologi sebagai bahan analisis. Selain itu, penyebaran program-program aplikasi bioinformatika melalui internet memudahkan ilmuwan dalam mengakses program-program tersebut dan kemudian memudahkan pengembangannya.

Pangkalan Data sekuens biologi dapat berupa pangkalan data primer untuk menyimpan sekuens primer asam nukleat dan protein, pangkalan data sekunder untuk menyimpan motif sekuens protein, dan pangkalan data struktur untuk menyimpan data struktur protein dan asam nukleat.

Pangkalan data utama untuk sekuens asam nukleat saat ini adalah GenBank (Amerika Serikat), EMBL (the European Molecular Biology Laboratory, Eropa), dan DDBJ (DNA Data Bank of Japan, Jepang). Ketiga pangkalan data tersebut bekerja sama dan bertukar data secara harian untuk menjaga keluasan cakupan masing-masing pangkalan data. Sumber utama data sekuens asam nukleat adalah submisi (pengumpulan) langsung dari peneliti individual, proyek sekuensing genom, dan pendaftaran paten. Selain berisi sekuens asam nukleat, entri dalam pangkalan data sekuens asam nukleat pada umumnya mengandung informasi tentang jenis asam nukleat (DNA atau RNA), nama organisme sumber asam nukleat tersebut, dan segala sesuatu yang berkaitan dengan sekuens asam nukleat tersebut.

Selain asam nukleat, beberapa contoh pangkalan data penting yang menyimpan sekuens primer protein adalah PIR (Protein Information Resource, Amerika Serikat), Swiss-Prot (Eropa), dan TrEMBL (Eropa). Ketiga pangkalan data tersebut telah digabungkan dalam UniProt, yang didanai terutama oleh Amerika Serikat. Entri dalam UniProt mengandung informasi tentang sekuens protein, nama organisme sumber protein, pustaka yang berkaitan, dan komentar yang pada umumnya berisi penjelasan mengenai fungsi protein tersebut.

Perangkat bioinformatika yang berkaitan erat dengan penggunaan pangkalan data sekuens Biologi ialah BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). Penelusuran BLAST (BLAST search) pada pangkalan data sekuens memungkinkan ilmuwan untuk mencari sekuens baik asam nukleat maupun protein yang mirip dengan sekuens tertentu yang dimilikinya. Hal ini berguna misalnya untuk menemukan gen sejenis pada beberapa organisme atau untuk memeriksa keabsahan hasil sekuensing atau untuk memeriksa fungsi gen hasil sekuensing. Algoritma yang mendasari kerja BLAST adalah penyejajaran sekuens.

PDB (Protein Data Bank, Bank Data Protein) ialah pangkalan data tunggal yang menyimpan model struktur tiga dimensi protein dan asam nukleat hasil penentuan eksperimental (dengan kristalografi sinar-X, spektroskopi NMR, dan mikroskopi elektron). PDB menyimpan data struktur sebagai koordinat tiga dimensi yang menggambarkan posisi atom-atom dalam protein atau pun asam nukleat.

PEMBAGIAN TUGASKELOMPOK 1

Pembagian Tugas Kelompok1

JOB DESCRIPTION

KELOMPOK 1

ANGGOTA KELOMPOK :

·         AI SERLIN CAHYANTI                       (50410437)

·         ANISA NOVITA SAPUTRI                               (50410876)

·         AQMAL DERRY STANZAH              (50410987)

·         BANGUN HADIKUSUMO                              (51410325)

·         FRADHIKA VIRGANTARA                              (52410865)

PEMBAGIAN TUGAS :

NAMA ANGGOTA	TUGAS
AI SERLIN CAHYANTI (50410437)	Mencari bahan untuk pembuatan artikel mengenai Pengertian Dasar Bisnis Informatika, yang terdiri dari sub materi : -          Perkembangan Bisnis Informatika -          Perkembangan Penggunaan TIK (Tek Informatika di Indonesia  dan dunia -          Jenis dan Tipe Bisnis di Bidang TIK Serta menyusun bahan yang telah di dapat menjadi sebuah artikel yang layak untuk di baca.
ANISA NOVITA SAPUTRI (50410876)	Mencari bahan untuk pembuatan artikel mengenai Pengertian Dasar Bisnis Informatika, yang terdiri dari sub materi : -          Perkembangan Bisnis Informatika -          Perkembangan Penggunaan TIK (Tek Informatika di Indonesia  dan dunia -          Jenis dan Tipe Bisnis di Bidang TIK Serta menyusun bahan yang telah di dapat menjadi sebuah artikel yang layak untuk di baca.
BANGUN HADIKUSUMO (51410325)	Melakukan survey ke perusahaan yang bergerak di bidang bisnis TI, dan mencari dokumen perusahaan yang dibutuhkan seperti : NPWP perusahaan, SIUP, Akte notaries, SPT pajak. Dll
FRADHIKA VIRGANTARA (52410865)	Melakukan survey ke perusahaan yang bergerak di bidang bisnis TI, dan mencari dokumen perusahaan yang dibutuhkan seperti : NPWP perusahaan, SIUP, Akte notaries, SPT pajak. Dll
AQMAL DERRY STANZAH (50410978)	Mengolah dan menyusun informasi yang telah di dapat dari perusahaan tersebut sehingga menjadi informasi yang berguna.

PROPOSAL PEMBUATAN BLOG

UNIVERSITAS GUNADARMA

 PROPOSAL PEMBUATAN BLOG

DITUJUKAN UNTUK MEMENUHI TUGAS MATA KULIAH PENGANTAR BISNIS INFORMATIKA

KELOMPOK 2 :

Ai Serlin Cahyanti                  (50410437)

Anisa Novita Saputri             (50410876)

Aqmal Derry Stanzah            (50410978)

Bangun Hadikusumo             (51410325)

Fradhika Virgantara              (52410865)

Ibnu Aditya                           

PROPOSAL PEMBUATAN BLOG

A.    LATAR BELAKANG

Internet saat ini telah menjadi bagian yang tidak terpisahkan dari kehidupan kita. semua aspek kehidupan telah memulai memanfaatkan fasilitas internet, tidak hanya perusahaan yang ingin memasaran produknya secara global. Tetapi juga pemerintahan, organisasi, partai politik, yayasan, lembaga dan bahkan individu juga telah menggunakan internet untuk mendapatkan kemudahan dalam memberikan layanan dan informasi, juga untuk kemudahan perluasan dan pengembangan bisnis.

Setiap waktunya internet semakin memasyarakat di Indonesia hal ini di tandai dengan semakin banyaknya pengguna internet dari tahun ke tahun dan akan terus bertambah. Di prediksikan tiap tahunnya pengguna internet di Indonesia meningkat tajam. Ini sangat masuk akal mengingat era globalisasi yang sudah mulai berjalan.

Blog itu sendiri adalah salah satu bentuk media massa yang publikasinya melalui jaringan internet. Blog ini dapat di akses 24 jam dan dari belahan bumi manapun. Kelebihan lain dari publikasi melalui Blog adalah kemampuan interaktif dan penyebarannya yang sangat cepat.

Melalui proposal ini kami ingin mengajukan penawaran pembuatan blog dan program aplikasi lain kepada bapak / ibu baik itu untuk perusahaan, organisasi, partai politik, individu atau untuk keperluan lainya. Dengan harga yang relative lebih murah dari rata-rata penyedia blog professional lainya, namun bapak / ibu tetap mendapatkan fasilitas yang lengkap dan layanan purna jual dari kami. Kami menyediakan beberapa kelebihan dalam pembuatan blog yang dapat di lihat dalam rincian proposal ini.

B.     BATASAN

1. Blog yang dibuat berdasarkan permintaan klien, baik desain maupun jenis blog

2. Pembuatan Blog dapat diselesaikan dalam jangka waktu 2 minggu setelah kesepakatan

C.    TUJUAN

Berikut ini  adalah tujuan penawaran kerja sama dalam pengajuan proposal ini, yaitu :

1. Memberikan layanan secara Online kepada klien
2. Membantu mempromosikan instansi yang anda pimpin sehingga   semakin dikenal oleh masyarakat umum.

D.    METODE YANG DIGUNAKAN

Dalam pembuatan blog yang kami buat menggunakan metode :

Kami selalu memberikan layanan yang ekslusif kepada semua klien kami yaitu denganmemberikan kebebasan klien kami dalam rangka pembuatan blog dengan design yang dinamis  baik itu tempelate atau data-data yang berada didalamnya. blog yang kami sediakan terdapat banyak feature yang di tawarkan antara lain:

ü  Fleksibilitas dalam design, data  dan maintain updates

ü  Utilitas yang lengkap dalam  blog

ü  Navigasi yang menarik, menggunakan menu pulldown apabila di perlukan (javascript)

ü  Tampilan / Theme yang banyak pilihan

E.     KEGIATAN

Dalam proses pembuatan blog,  yang diperlukan adalah sebagai berikut :

-          Buat email

-          Mengunjungi situs blog

-          Masukkan alamat email dan password pada  blog tersebut untuk verifikasi

-          Isi kolom judul dan alamat kemudian pilih template yang diinginkan

F.     SUMBER DAYA YANG DIGUNAKAN

Untuk pembuatan blog pada perusahaan kami akan dikerjakan oleh orang-orang yang kompeten didalam bidangnya. Selain sumber daya manusianya perangkat yang kami gunakan dalam pembuatan blog sesuai dengan spesifikasi yang diperlukan.

G.    WBS

A.    ANALISIS

A.    BIAYA

Biaya sewa domain.

1. Domain .com           : sekitar 11.99$ / tahun

2. Domain.net                         : sekitar 9.99$/tahun

3. Domain.org             : sekitar 9.99$/tahun

4. Domain.info            : sekitar 1.99$/tahun

Biaya sewa hosting.

1.      Economi          :4.99$ /bulan – minimal 3 bulan.

- 10 GB Space
- Unlimited Bandwidth

2. Deluxe               : 7.99$/ bulan

- 150 GB Space
- Unlimited Blogs^oo& Bandwidth

3. Unlimited          : 14.99 $/bulan

- Unlimited Blogs^oo, Space &   Bandwidth

Harga Blog murah sesuai dengan fasilitas yang anda terima.

Paket 1.  Harga Rp.200.000,-

1.      Satu akun Blog domain NamaBlog.blogspot.com

2.      Ganti Template sesuai permintaan anda

3.      Desain Logo Blog

4.      Pasang Widget sesuai permintaan

5.      Satu Artikel sesuai tema blog.

Paket 2. Harga Rp.250.000,-

1.      Mendapatkan semua Fasilitas Paket 1.

2.      Desain Blog "Header, Footer, Widget, dll"

3.      Submit Blog ke Search Engine ternama "Google, Yahoo, Bing" dan Search Engine lainnya.

Paket 3. Harga Rp.350.000,-

1.      Mendapatkan semua Fasilitas Paket 2.

2.      Edit Template Hingga Valid HTML 5 Minimal <30 Eror

3.      Optimasi SEO Onpage Meliputi :

o    Meta Tag "Title, Keyword, Deskription, Robot txt, dll" hasil riset saya pribadi yang terbukti SEO Friendly.

o    Optimasi Tag Heading "H1,H2,H3 - H6"

o    Breadcumb

o    Rich Snippest

Paket 4. Harga Rp.450.000,-

1.      Mendapatkan semua Fasilitas Paket 3.

2.      Domain NamaBlog.com untuk 1 Tahun. dan dapat diperpanjang setiap tahunnya hanya Rp.150.000 untuk biaya perpanjang di tahun berikutnya.

Paket 5. Harga Rp.150.000,-

1.      Jasa Optimasi SEO Onpage Meliputi :

o     Meta Tag "Title, Keyword, Deskription, Robot txt, dll" hasil riset saya pribadi yang terbukti SEO Friendly.

o     Optimasi Tag Heading "H1,H2,H3 - H6"

o     Breadcumb

o     Rich Snippest 

Paket 6. Harga Rp. 150.000,-

1.      Jasa Edit HTML hingga Valid HTML 5 Minimum Eror 15-30 tergantung template yang digunakan dan diusahakan se valid mungkin.

Paket 7. Harga Rp. 250.000,-

1.      Gabungan Paket 5 dan Paket 6.

Paket 8. Harga 100.000,-/Bulan

1.      Jasa Pasang iklan di blog saya yang lain dengan trafik ribuan visitor mulai 1000 - 10.000

B.     WAKTU

1.      Untuk Blog waktu pengerjaan 1 ~ 7 hari, Blog berbayar 1-2 minggu,  tergantung dari kesiapan/kelengkapan pemesan dalam penyediaan konten. 

2.      Dalam pengerjaan kami dan pemesan dapat ber komunikasi demi kelancaran dalam proses pengerjaan blog/blog.

Garansi:

1.      Garansi Blog/blog adalah 2 bulan

2.      Kerusakan atau Error dalam masa Garansi menjadi tanggung jawab kami kecuali kerusakan disebabkan kecerobohan/kelalaian pemesan.

C.    GAMBAR

Contoh blog menggunakan blogspot

Contoh blog menggunakan wordpress

A.    RANCANGAN

Pada proses pembuatan blog perusahaan kami menerima jika ada klien yang ingin merancangan tampilan blog sendiri dan kami juga menyediakan jasa pembuatan rancangan blog. Blog yang kami buat bersifat dinamis sehingga tampilannya lebih menarik dan tidak monoton.

B.     PENUTUP

            Demikian Proposal paket pembuatan blog yang kami tawarkan kepada Bapak/Ibu dan dapat manjadi pertimbangan. Besar harapan kami untuk dapat bekerja sama dengan bapak/ibu dalam pembuatan blog ini. Bilamana bapak/ibu memerlukan blog dengan spesifikasi yang bapak/ibu inginkan silahkan hubungi kami kembali. Sekian dan atas perhatian bapak/ibu kami ucapkan terima kasih.

                                                                                                Hormat Kami

                                                                                   

                                                                                               

                                                                                                  Roof Cyber

sistem operasi dalam web

Sistem operasi adalah seperangkat program yang mengelola sumber daya perangkat keras komputer, dan menyediakan layanan umum untuk aplikasi perangkat lunak. Sistem operasi adalah jenis yang paling penting dari perangkat lunak sistem dalam sistem komputer. Tanpa sistem operasi, pengguna tidak dapat menjalankan program aplikasi pada komputer mereka, kecuali program aplikasi boot diri.
Waktu-berbagi jadwal tugas sistem operasi untuk penggunaan yang efisien dari sistem dan juga dapat mencakup akuntansi untuk alokasi biaya waktu prosesor, penyimpanan massa, cetak, dan sumber daya lainnya.
Untuk fungsi-fungsi perangkat keras seperti sebagai masukan dan keluaran dan alokasi memori, sistem operasi bertindak sebagai perantara antara program aplikasi dan perangkat keras komputer, meskipun kode aplikasi biasanya dieksekusi langsung oleh perangkat keras dan seringkali akan menghubungi OS atau terputus oleh itu. Sistem operasi yang ditemukan pada hampir semua perangkat yang berisi komputer-dari ponsel dan konsol permainan video untuk superkomputer dan server web.
Perkembangan Pemograman Web
Dalam dunia internet kita selalu mendengar istilah web. Istilah ini sebenarnya adalah istilah pendek dari World Wide Web ( disingkat www). Web ini adalah suatu ruang informasi dimana sumber-sumber daya yang berguna diidentifikasi oleh pengenal global yang disebut Uniform Resource Identifier ( URI ). Web sering dianggap identik dengan internet dan merupakan bagian dari internet tersebut. Halaman web biasanya diatur dalam koleksi material yang berkaitan yang disebut dengan situs web.
Halaman web merupakan file teks murni ( plain text) yang berisi sintaks-sintaks HTML Sintaks HTML mampu memuat konten text, gambar, audio, video dan animasi yang dapat dibuka atau dilihat dengan internet browser. Halaman-halaman dari sebuah situs internet atu web diakses dari sebuah URL ( Uniform Resource Locator ) yang menjadi akar ( root ) yang disebut homepage dan biasanya disimpan dalam server yang sama.
Sedangkan pemrograman web diambil dari 2 suku kata yaitu pemrograman dan web. Pemrograman yang dalam bahasa English adalah programming dan diartikan proses, cara, perbuatan program (secara bahasa indonesia). Definisi Web : jaringan komputer yang terdiri dari kumpulan situs internet yang menawarkan teks dan grafik dan suara dan sumber daya animasi melalui protokol transfer hypertext. Orang banyak mengenal web dengan istilah WWW (world wide web), World Wide Web adalah layanan internet yang paling populer saat ini
HTTP
HTTP (HyperTextTransfer Protocol) adalah protocol yang dipergunakan untuk mentransfer dokumen dalam World Wide Web(WWW). Protokol ini adalah protokol ringan, tidak berstatus dan generik yang dapat dipergunakan berbagai macam tipe dokumen. Pengembangan HTTP dikoordinasi oleh Konsorsium World Wide Web (W3C) dan grup bekerja Internet Engineering Task Force(IETF), bekerja dalam publikasi satu seri RFC yang paling terkenal RFC 2616 yang menjelaskan HTTP/1,1. HTTP adalah sebuah protokol meminta/menjawab antara client dan server. Sebuh client HTTP seperti web browser, biasanya memulai permintaan dengan membuat hubungan TCP/IP ke port tertentu di tuan rumah yang jauh (biasanya port 80). Sebuah server HTTP yang mendengarkan diport tersebut menunggu client mengirim kode permintaan (request), seperti "GET / HTTP/1.1" (yang akan meminta halaman yang sudah ditentukan), diikuti dengan pesan MIME yang memiliki beberapa informasi kode kepala yang menjelaskan aspek dari permintaan tersebut, diikut dengan badan dari data tertentu. Beberapa kepala (header) juga bebas ditulis atau tidak, sementara lainnya (seperti tuan rumah) diperlukan oleh protokol HTTP/1,1. Begitu menerima kode permintaan (dan pesan, bila ada), server mengirim kembali kode jawaban, seperti "200 OK", dan sebuah pesan yang diminta, atau sebuah pesan error atau pesan lainnya